Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ddx28Q9CWT6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ddx28Q9CWT6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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