Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pfdn1Q9CWM4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pfdn1Q9CWM4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pfdn1Q9CWM4 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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