Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdca4Q9CWM2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms