Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms