Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccer1Q9CQL2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccer1Q9CQL2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccer1Q9CQL2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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