Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rab5aQ9CQD1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms