Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Use1Q9CQ56 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Use1Q9CQ56 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Use1Q9CQ56 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Use1Q9CQ56 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Use1Q9CQ56 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Use1Q9CQ56 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Use1Q9CQ56 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Use1Q9CQ56 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Use1Q9CQ56 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Use1Q9CQ56 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Use1Q9CQ56 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Use1Q9CQ56 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Use1Q9CQ56 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Use1Q9CQ56 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Use1Q9CQ56 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Use1Q9CQ56 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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