Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg3Q9CPX6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms