Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Bhlhe41Q99PV5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms