Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp1b4Q99ME6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms