Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms