Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pagr1aQ99L02 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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