Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms