Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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TrabdQ99JY4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TrabdQ99JY4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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