Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms