Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cldn16Q925N4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn16Q925N4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Cldn16Q925N4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Cldn16Q925N4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Cldn16Q925N4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Cldn16Q925N4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Cldn16Q925N4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Cldn16Q925N4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Cldn16Q925N4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Cldn16Q925N4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Cldn16Q925N4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cldn16Q925N4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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