Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PdgfdQ925I7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PdgfdQ925I7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PdgfdQ925I7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PdgfdQ925I7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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