Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Xrcc4Q924T3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc4Q924T3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc4Q924T3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Xrcc4Q924T3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc4Q924T3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Xrcc4Q924T3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc4Q924T3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc4Q924T3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc4Q924T3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xrcc4Q924T3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Xrcc4Q924T3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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