Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Smc1bQ920F6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Smc1bQ920F6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Smc1bQ920F6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Smc1bQ920F6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Smc1bQ920F6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Smc1bQ920F6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Smc1bQ920F6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Smc1bQ920F6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Smc1bQ920F6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smc1bQ920F6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smc1bQ920F6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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