Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dkk4Q8VEJ3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms