Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39cQ8VE09 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms