Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Dnajc28Q8VCE1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Dnajc28Q8VCE1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Dnajc28Q8VCE1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Dnajc28Q8VCE1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Dnajc28Q8VCE1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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