Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ApobrQ8VBT6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms