Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Top1mtQ8R4U6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Top1mtQ8R4U6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Top1mtQ8R4U6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Top1mtQ8R4U6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Top1mtQ8R4U6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top1mtQ8R4U6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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