Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf183Q8QZS5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms