Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Vrk3Q8K3G5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Vrk3Q8K3G5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Vrk3Q8K3G5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Vrk3Q8K3G5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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