Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prpf39Q8K2Z2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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