Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn34c1Q8K193 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms