Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms