Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LgsnQ8CIX8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms