Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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