Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trerf1Q8BXJ2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trerf1Q8BXJ2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trerf1Q8BXJ2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trerf1Q8BXJ2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trerf1Q8BXJ2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trerf1Q8BXJ2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trerf1Q8BXJ2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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