Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pdcl3Q8BVF2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pdcl3Q8BVF2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pdcl3Q8BVF2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pdcl3Q8BVF2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdcl3Q8BVF2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms