Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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