Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms