Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Atg4dQ8BGV9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Atg4dQ8BGV9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Atg4dQ8BGV9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Atg4dQ8BGV9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Atg4dQ8BGV9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Atg4dQ8BGV9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Atg4dQ8BGV9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
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