Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Atg4bQ8BGE6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms