Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms