Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms