Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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