Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Clec18aQ7TSQ1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Clec18aQ7TSQ1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Clec18aQ7TSQ1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Clec18aQ7TSQ1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Clec18aQ7TSQ1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Clec18aQ7TSQ1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Clec18aQ7TSQ1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Clec18aQ7TSQ1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Clec18aQ7TSQ1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Clec18aQ7TSQ1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Clec18aQ7TSQ1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Clec18aQ7TSQ1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Clec18aQ7TSQ1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Clec18aQ7TSQ1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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