Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf139Q7TMV1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf139Q7TMV1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf139Q7TMV1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf139Q7TMV1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf139Q7TMV1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf139Q7TMV1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf139Q7TMV1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf139Q7TMV1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf139Q7TMV1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf139Q7TMV1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf139Q7TMV1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf139Q7TMV1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf139Q7TMV1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf139Q7TMV1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rnf139Q7TMV1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf139Q7TMV1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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