Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih3Q6ZWS4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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