Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Glis3Q6XP49 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Glis3Q6XP49 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Glis3Q6XP49 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Glis3Q6XP49 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Glis3Q6XP49 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Glis3Q6XP49 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Glis3Q6XP49 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Glis3Q6XP49 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Glis3Q6XP49 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Glis3Q6XP49 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms