Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Timd4Q6U7R4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Timd4Q6U7R4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Timd4Q6U7R4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Timd4Q6U7R4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Timd4Q6U7R4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Timd4Q6U7R4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Timd4Q6U7R4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Timd4Q6U7R4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timd4Q6U7R4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms