Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
BC061212Q6P8K3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms