Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms