Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CltbQ6IRU5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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