Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Jmjd1cQ69ZK6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms