Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ric1Q69ZJ7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ric1Q69ZJ7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms